Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rad54lP70270 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad54lP70270 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms