Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf6P70196 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf6P70196 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms