Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcbP68404 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms