Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb4bP68372 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb4bP68372 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms