Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabrb3P63080 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms