Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gnb1P62874 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gnb1P62874 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms