Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl18aP62717 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl18aP62717 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms