Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f4P62515 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f4P62515 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms