Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd1P62315 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd1P62315 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms