Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm3P62311 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms