Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg6P61406 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg6P61406 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg6P61406 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms