Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snap25P60879 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snap25P60879 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snap25P60879 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms