Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppfia3P60469 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ppfia3P60469 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms