Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b6P59708 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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