Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hps5P59438 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hps5P59438 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms