Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup43P59235 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup43P59235 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms