Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Paxbp1P58501 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Paxbp1P58501 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms