Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Setd4P58467 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd4P58467 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Setd4P58467 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms