Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samsn1P57725 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samsn1P57725 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms