Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcbp3P57722 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcbp3P57722 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms