Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lim2P56563 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lim2P56563 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lim2P56563 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms