Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gp1bbP56400 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms