Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pex2P55098 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pex2P55098 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms