Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad23aP54726 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms