Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fdft1P53798 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms