Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Map3k1P53349 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Map3k1P53349 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms