Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efna1P52793 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Efna1P52793 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Efna1P52793 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Efna1P52793 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Efna1P52793 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna1P52793 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna1P52793 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna1P52793 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna1P52793 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Efna1P52793 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms