Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Matn1P51942 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Matn1P51942 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms