Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ApodP51910 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApodP51910 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApodP51910 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApodP51910 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApodP51910 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApodP51910 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApodP51910 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApodP51910 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApodP51910 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApodP51910 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApodP51910 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ApodP51910 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms