Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Opn1swP51491 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms