Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RoraP51448 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RoraP51448 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RoraP51448 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RoraP51448 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RoraP51448 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RoraP51448 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RoraP51448 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RoraP51448 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RoraP51448 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RoraP51448 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms