Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms