Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmod1P49813 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms