Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Hnf4aP49698 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hnf4aP49698 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hnf4aP49698 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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