Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtpreP49446 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpreP49446 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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