Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca1P48754 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brca1P48754 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brca1P48754 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms