Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abcd1P48410 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd1P48410 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms