Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl5P47962 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms