Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic1P46684 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic1P46684 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms