Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms