Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf9P41274 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf9P41274 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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