Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TfamP40630 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TfamP40630 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TfamP40630 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TfamP40630 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TfamP40630 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms