Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf2P39429 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms