Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lig1P37913 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms