Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PpargP37238 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpargP37238 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpargP37238 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PpargP37238 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PpargP37238 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PpargP37238 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PpargP37238 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpargP37238 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms