Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PtprkP35822 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PtprkP35822 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms