Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms