Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab17P35292 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab17P35292 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms