Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab5cP35278 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms