Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd1P33215 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms